De rechtbank wordt geleid door een bestuur dat is belast met de algemene leiding, de organisatie en de bedrijfsvoering van de rechtbank.

Samenstelling:

• mw. mr. A.F. (Andrea) Gerding (president)
  

• mr. P. (Peter) Molema (rechterlijk lid)
  

• mw. mr. M.P. (Madelon) de Wilde (niet-rechterlijk lid)

Het gerechtsbestuur wordt ondersteund door het bestuursbureau.

De behandeling van zaken is binnen rechtbank Noord-Nederland organisatorisch verdeeld onder drie juridische clusters: bestuursrecht, privaatrecht en strafrecht.

Naast de juridische clusters is er ook een cluster bedrijfsvoering. Deze bevat alle (ondersteunende) teams, zoals bijvoorbeeld P&O, communicatie en huisvesting. 

Rechtbank Noord-Nederland heeft locaties in de provincies Drenthe, Friesland en Groningen. Elk gerechtsgebouw heeft een eigen geschiedenis.

In 2014 is de Wet gebruik Friese taal in werking getreden. Hierin staan regels over het procederen in de Friese taal bij gerechtshof Arnhem-Leeuwarden. Deze wet geldt voor alle zittingslocaties die binnen dit werk- en rechtsgebied vallen.