Een aantal stichtingen en milieubedrijven is het niet eens met het verlenen van de vergunning. Volgens deze eisers mocht de provincie bij haar besluit niet zomaar uitgaan van de emissiefactoren die in de Rav staan. Zij halen daarbij rapporten aan die ook in diverse andere rechtszaken zijn gebruikt. Zij hebben berekend dat, als de luchtwasser meer ammoniak doorlaat dan de Rav belooft, geen sprake is van een daling van de ammoniakuitstoot maar van een toename daarvan en daarmee ook van een toename van stikstof op het nabijgelegen Natura 2000-gebied.