Vluchtelingenwerk zet zich in voor asielzoekers en vluchtelingen door begeleiding in de asielprocedure, ondersteuning en begeleiding bij toelating, opvang, integratie en terugkeer. Zij is daarvoor aanwezig in asielzoekerscentra en opvanglocaties door het hele land en werkt samen met andere organisaties in de migratieketen zoals het Centraal Orgaan opvang asielzoekers (COA), de Immigratie- en Naturalisatiedienst (IND) en de Dienst Terugkeer & Vertrek (DT&V). Vluchtelingenwerk diende een voorlopige voorziening in bij de rechtbank Amsterdam, omdat de minister een subsidiebesluit had genomen waarin zij 13 miljoen euro subsidie toekent in plaats van het aangevraagde bedrag van ruim 34 miljoen euro. Volgens Vluchtelingenwerk staat dit besluit haaks op de langjarige praktijk waarin Vluchtelingenwerk, gedurende het kalenderjaar, nog aanvullende subsidie kreeg. Met het toegekende subsidiebedrag kan Vluchtelingenwerk niet alle taken uitvoeren die zij bij haar aanvraag had benoemd en die zij volgens het besluit wel moet uitvoeren. Zij zal moeten reorganiseren om de subsidiewijziging op te vangen, maar dat kan volgens Vluchtelingenwerk pas als duidelijkheid bestaat over het afbouwplan waaraan momenteel, onder leiding van de minister, wordt gewerkt.