Langs het traject staan 25 bijzondere bomen, waarvan er volgens de verleende vergunning 12 behouden kunnen blijven. De rechter heeft wel redenen gevonden om, in aanvulling op die 12 te behouden bomen, de vergunning te schorsen voor 9 bijzondere bomen. Voor iedere bijzondere boom moet een afzonderlijke beoordeling plaatsvinden omdat voor elk van die bomen individueel de beschermde belangen van natuur- en milieuwaarden en belevings- en gebruikswaarden moeten worden afgezet tegen het belang van de aanleg van het tramspoor. Voor deze 9 bijzondere bomen is die belangenafweging onvoldoende geweest, Dat zal in de bezwaarfase alsnog kunnen plaatsvinden. Zo kan er bekeken worden of behoud van die 9 bijzondere bomen toch mogelijk is. Om die reden heeft de voorzieningenrechter de vergunning geschorst tot zes weken na de beslissing op bezwaar voor deze 9 bomen.