De rechtbank geeft met een voorbehoud aan dat voor grondwateronttrekkingen met putten die zijn geslagen voordat de Peel Europees rechtelijk werd beschermd (in 1994) en die zijn vergund of geregistreerd, in beginsel geen natuurvergunning (en dus ook geen algemene vrijstelling) nodig is. Die putten mogen nog steeds worden gebruikt. De rechtbank oordeelt verder dat de provincies op basis van het onderzoek terecht geen algehele vrijstelling hebben opgenomen in het beheerplan, omdat nadelige gevolgen van deze grondwateronttrekkingen voor de grondwaterstand en voor de Peel niet kunnen worden uitgesloten.
De boeren en bonden benadrukken nog dat de geringe oppervlakte (herstellend) hoogveen niet opweegt tegen hun economische belangen. De Peel krijgt echter de volle 100% bescherming van de nationale regelgeving en de Europese Habitatrichtlijn. Ook al gaat het om een kleine oppervlakte hoogveen, dat wil niet zeggen dat andere belangen voorrang krijgen ten koste van de natuur.